The Netherlands
December 11, 2024
Naktuinbouw Laboratories has improved the dilution plating test for the detection of Xanthomonas ‘bacterial spot’ pathogens on tomato, pepper and eggplant seeds. After dilution plating all suspect colonies are confirmed with a real-time PCR assay. For this assay the markers have been improved in line with the seed extract PCR. This allows detection of the taxonomic groups Xanthomonas hortorum pv. gardneri, Xanthomonas vesicatoria and Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria and Xanthomonas euvesicatoria pv. perforans (the latter two cannot be distinguished).
The confirmation PCR is a technique for sensitive detection of specific species
The method involves collecting bacterial colonies from the dilution plating plates and extracting their DNA. Pathogen-specific markers are then used to confirm the presence a specific bacteria. This makes it possible to confirm with more certainty whether the seed samples actually contain the live pathogen.
Bacteria
The species Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria, X. euvesicatoria pv. perforans, X. hortorum pv. gardneri and X. vesicatoria (formerly known as the X. campestris pv. vesicatoria complex) result in necrotic spots on all above ground plant parts and result in significant crop losses, primarily in tomato and pepper.
Xvepg on seeds of tomato, pepper or eggplant
- Test code: XCVA100 or XCVA300
- Sample size: 10.000 or 30.000 seeds
- Test fee*: € 231 resp. € 307
- Duration test: 17 days
* For basic fees see price list 2024
Verbeterde uitplaatmethode voor 'bacterial spot' op tomaat, paprika en aubergine verbeterd
Naktuinbouw Laboratoria heeft de uitplaatmethode voor de detectie van Xanthomonas 'bacterial spot' pathogenen op zaden van tomaat, paprika en aubergine verbeterd. Na uitplaat worden alle verdachte kolonies bevestigd met een real-time PCR. Voor deze test zijn de markers verbeterd in lijn met de zaadextract-PCR. Dit maakt detectie mogelijk van de taxonomische groepen Xanthomonas hortorum pv. gardneri, Xanthomonas vesicatoria en Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria en Xanthomonas euvesicatoria pv. perforans (de laatste twee kunnen niet worden onderscheiden).
De bevestiging qPCR is een techniek voor gevoelige detectie van specifieke species
De methode omvat het verzamelen van bacteriekolonies van de verdunningsplaten en het extraheren van DNA. Pathogeen-specifieke markers worden vervolgens gebruikt om de aanwezigheid van een specifieke bacterie te bevestigen. Dit maakt het mogelijk om met meer zekerheid te bevestigen of de zaadmonsters de levende pathogeen daadwerkelijk bevatten.
Bacterie
De species Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria, X. euvesicatoria pv. perforans, X. hortorum pv. gardneri and X. vesicatoria (vroeger gekend als het X. campestris pv. vesicatoria complex) veroorzaken necrotische vlekken op alle bovengrondse plantendelen. Deze leiden, voornamelijk in tomaat en paprika, tot aanzienlijke oogstverliezen.
Xvepg op zaden tomaat, paprika of aubergine
- Test code: XCVA100 of XCVA300
- Monster: 10.000 of 30.000 zaden
- Tarief toets*: € 231 respectievelijk € 307
- Duur toets: 17 dagen
* Voor basisbedragen zie tarievenlijst 2024
Topics
Species
