The Netherlands
May 29, 2024
Naktuinbouw Laboratories has developed two new tests for the detection of pathogens on tomato, pepper and eggplant to support the sector.
Plating protocols currently exist for testing seeds for Xanthomonas 'bacterial spot' pathogens (tomato, pepper and eggplant) and Pseudomonas syringae pv. tomato (tomato). However, the plating method often leads to invalid results, by overgrowth in 'dirty' samples. Therefore, a pre-screening method was implemented for both pathogens. This is fast and reliable and is less susceptible to saprophyts.
These tests can be performed as a combi-test with the SE-PCR already available for Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis on tomato seeds.
Rapid DNA screening for presence of pathogens
Plating assays consist of serial tests which is time consuming, but the SE-PCR is a fast pre-screening. We perform this PCR test directly on the seeds.
The disadvantage is that it is not possible to distinguish between live and dead pathogens, but is very suitable as a rapid pre-screening method.
Bacteria
The species Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria, X. hortorum pv. gardneri, X. euvesicatoria pv. perforans and X. vesicatoria (formerly known as the X. campestris pv. vesicatoria complex) result in necrotic spots on all above ground plant parts and result in significant crop losses, primarily in tomato and pepper.
Pseudomonas syringae pv. tomato causes dark specks on various parts of tomato plants and can result in stunted growth and yield losses in this crop.
Xanthomonas ‘bacterial spot’ SE-PCR on seeds of tomato, pepper or eggplant
- Test code: COMBIXVEPGQ100
- Sample size: 10.000 untreated seeds
- Test fee: € 285
- Duration test: 5 days
Combi Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, Xanthomonas ‘bacterial spot’ and Pseudomonas syringae pv. tomato SE-PCR on tomato seeds
- Test code: COMBICPXQ100
- Sample size: 10,000 untreated seeds
- Test fee: € 362
- Duration test: 5 days
Naktuinbouw Laboratories supports the sector
To support the sector, Naktuinbouw Laboratories continues to develop new tests that can support diagnoses on plants and seeds with symptoms or just checking for and guaranteeing absence from certain plant pathogens.
For basic fees see price list 2024.
Nieuwe ZE-PCR toetsen voor tomaat, paprika en aubergine
We ontwikkelden twee nieuwe toetsen voor de detectie van Xanthomonas ‘bacterial spot’ pathogenen (tomaten, paprika en aubergine) en Pseudomonas syringae pv. tomato (tomaat).
Er bestaan momenteel uitplaatprotocollen voor het testen van zaden op Xanthomonas ‘bacterial spot’ pathogenen (tomaat, paprika en aubergine) en Pseudomonas syringae pv. tomato (tomaat). De uitplaatmethode leidt echter vaak tot ongeldige resultaten, door overgroei bij 'vieze' monsters. Daarom is een pre-screeningmethode voor beide pathogenen geïmplementeerd. Deze is snel en betrouwbaar en is minder gevoelig voor saprofyten.
Deze testen kunnen op tomatenzaden worden uitgevoerd als een combi-test met de ZE-PCR die al beschikbaar is voor Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis
Snelle DNA-screening aanwezigheid ziekteverwekkers
Waar uitplaattoetsen bestaan uit meerdere testen die elkaar opvolgen en daardoor tijdrovend zijn, is de ZE-PCR een snelle voorscreening. Deze PCR voeren we rechtstreeks op het zaad uit.
Met de ZE-PCR kan helaas geen onderscheid gemaakt worden tussen levende en dode pathogenen, maar is wel zeer geschikt als snelle voorscreeningsmethode.
Bacteriën
De species Xanthomonas euvesicatoria pv. euvesicatoria, X. hortorum pv. gardneri, X. euvesicatoria pv. perforans en X. vesicatoria (vroeger gekend als het X. campestris pv. vesicatoria complex) veroorzaken necrotische vlekken op alle bovengrondse plantendelen en leiden tot aanzienlijke oogstverliezen, voornamelijk in tomaat en paprika.
Pseudomonas syringae pv. tomato veroorzaakt donkere vlekken op verschillende delen van tomatenplanten en kan leiden tot groeistoornissen en opbrengstverliezen in dit gewas.
Xanthomonas ‘bacterial spot’ ZE-PCR op aubergine-, paprika- en tomatenzaden
- Test code: COMBIXVEPGQ100
- Monster: 10.000 onbehandelde zaden
- Tarief toets: € 285
- Duur toets: 5 dagen
Combi Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis, Xanthomonas ‘bacterial spot’ en Pseudomonas syringae pv. tomato ZE-PCR op tomatenzaden
- Test code: COMBICPXQ100
- Monster: 10.000 onbehandelde zaden
- Tarief toets: € 362
- Duur toets: 5 dagen
Naktuinbouw Laboratoria ondersteunen de sector
We blijven de sector ondersteunen door nieuwe toetsen te ontwikkelen. Deze toetsen ondersteunen een juiste diagnose op planten met symptomen of helpen bij het controleren op en garanderen van vrijheid van bepaalde plantpathogenen.
Voor basisbedragen zie tarievenlijst 2024.