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July 14, 2024
ToBRFV : Partage de connaissance et stratégie de sélection chez Bayer
Le virus ToBRFV a bouleversé le secteur de la tomate dans le monde entier. Le virus est inoffensif pour l'homme mais peut causer des dommages importants sur les cultures. En outre, il est très contagieux et peut survivre pendant longtemps. Alors que le secteur apprend à faire face au virus, les sélectionneurs l'envisagent dans une perspective plus large : ce n'est pas le dernier virus auquel le secteur devra faire face. Quelles leçons en tirent-ils pour l'avenir ? Jan Barten, chef de projet stratégique ToBRFV chez Bayer Crop Science, nous informe.
Premiers rapports
Le ToBRFV (Le virus du fruit rugueux brun de la tomate) circule dans le secteur de la tomate depuis dix ans. En 2014, les premiers signalements sont venus du Moyen-Orient : Jordanie et Israël. « Ensuite, il est resté en sommeil pendant quelques années, sans que nous soyons conscients du danger potentiel », reconstitue Jan. « À partir de 2018, il a commencé à se répandre rapidement sur d'autres marchés : Mexique et Allemagne. »
Selon lui, la propagation à l'échelle mondiale du virus a des causes multiples. De plus, le virus peut rester pendant des années dans la matière organique, comme le sol, mais également sur la matière inorganique. Il peut rester sur une surface pendant des mois et être toujours infectieux. Une poignée de porte, un ordinateur, un téléphone portable ou même un chariot de récolte. La transmission mécanique est également très efficace, ce qui facilite la propagation du virus.
De la panique au statut de quarantaine
Tout cela n'était pas connu à l'époque. Cependant, de plus en plus de producteurs étaient confrontés à ce virus mystérieux et particulièrement tenace. Cela a provoqué une panique dans le secteur de la tomate. En novembre 2019, le ToBRFV a reçu le statut de quarantaine en Europe. Cela signifie que les producteurs sont tenus de signaler un foyer et de prendre des mesures strictes pour empêcher sa propagation. Mais il était trop tard.
“En fin de compte, c'est tout le secteur de l'horticulture sous serre qui a été touché : un grand pourcentage de la surface a été infecté par le virus. Les producteurs de tomates se sont tournés vers d'autres variétés ou ont choisi de cultiver des concombres.”
La sélection
L'entreprise a décidé de mettre l'accent sur le partage de connaissances, afin d'informer les producteurs sur le virus et les mesures phytosanitaires nécessaires. En ce qui concerne la sélection, Bayer a mis au point une stratégie à deux volets. À plus long terme, une recherche à grande échelle de nouveaux gènes de résistance a été lancée.
Il existe des espèces de tomates sauvages : à fruits verts, à petits fruits ou même sans fruits. Elles sont apparentées aux tomates et peuvent posséder des gènes de résistance. Les introduire dans notre gamme commerciale est un processus long et compliqué. Les résultats de ce processus apparaîtront dans les années à venir.
La disponibilité de nombreuses variétés résistantes est déjà due à la stratégie à court terme de Bayer.
Dans ce cas, on a travaillé avec des gènes résistants déjà présents dans des variétés ayant une certaine valeur culturelle mais ne convenant pas à l'horticulture sous serre. En combinant ces gènes dans un contexte génétique approprié, un niveau élevé de résistance a été développé.
Une situation des plus complexes
Cela semble simple, mais ce n'est pas le cas. En fait, Jan, qui a plus de 30 ans d'expérience dans le domaine de la sélection, estime que cette épidémie est la situation la plus complexe qu'il ait rencontrée dans le domaine des maladies de la tomate. Il y a plusieurs raisons à cela. Par exemple, la gravité des symptômes lors d'une épidémie du virus est en partie déterminée par les conditions de la culture.
« Dans une culture stressée, on observe des symptômes beaucoup plus graves que dans une culture végétative. Les mesures phytosanitaires prises dans une serre jouent également un rôle important dans la gravité de l'infestation. Mais surtout, la résistance au virus n'est pas déterminée par un ou deux gènes, comme c'est le cas pour de nombreux autres virus, mais par un nombre beaucoup plus important. »
“Pour la plupart des virus, vous recherchez un gène de résistance dans votre patrimoine génétique. On l'a ou on ne l'a pas. Parfois, il faut deux gènes, ou le gène est récessif, ce qui nécessite deux lignées parentales récessives. Dans le cas du virus ToBRFV, beaucoup plus de gènes sont impliqués. ”
L'étude du virus a appris aux sélectionneurs qu'il existe des symptômes à la fois sur les feuilles et sur les fruits. « La façon dont les symptômes se manifestent dépend des gènes de la plante et les différentes variétés réagissent donc différemment au virus. Certaines sont fortes contre les symptômes sur feuilles, mais pas contre les symptômes sur fruits, et vice versa ».
Cela était déjà évident lors de l'épidémie initiale au Moyen-Orient, où les producteurs ont choisi des variétés qui semblaient moins sensibles aux symptômes sur les fruits. Mais l'acquisition d'une résistance à un tel virus nécessite une sélection complexe.
“Plus il y a de gènes à suivre, plus c'est complexe. C'est pourquoi il faut plus de temps pour mettre au point un produit commercialisable. En outre, chaque gène introduit peut également affecter d'autres caractéristiques de la variété. En somme, il s'agit d'une situation nouvelle pour les sélectionneurs. la résistance n'est pas tout blanc ou tout noir. ”
La recherche
Pour mieux connaitre le virus, Bayer a investi massivement dans la recherche. Une serre a été construite à Wageningen aux Pays Bas, où les variétés sont infectées artificiellement. Cette serre a une capacité considérable et convient à la culture commerciale de tomates Il s'agit d'une tâche difficile, car le virus ToBRFV est une maladie de quarantaine, et l'installation doit donc répondre à des exigences strictes. « Nous pouvons maintenant voir, par exemple, comment les variétés réagissent à l'infection en cas de stress, et nous pouvons étudier les effets au niveau de la plante et du fruit. »
Cela ne signifie pas que toutes les variétés de Bayer sont désormais résistantes, ni que tous les producteurs utilisent des variétés résistantes. C'est encore trop complexe pour cela.
« Trouver les bonnes résistances et la qualité de la variété, c'est trouver un équilibre. Il ne faut pas faire de compromis sur le rendement ou le goût. » En outre, l'entreprise fixe des normes élevées. « Comme il s'agit d'un virus très complexe, il n'existe pas de résistance générale unique. Nous voulons fournir au marché des informations détaillées sur la mesure dans laquelle les variétés peuvent encore présenter des symptômes du virus dans la culture et les fruits en cas de forte infestation. Nous menons de nombreuses recherches à ce sujet ». L'histoire n'est donc pas simple, et il constate que cela se reflète également dans le secteur.
« On entend beaucoup parler de variétés résistantes, mais ce n'est pas si simple. Il n'y a pas eu de définition claire de ce que signifie exactement la résistance, bien que des travaux soient en cours à ce sujet ».
Pour Jan, une chose est plus que claire : ce n'est pas le dernier virus qui affectera l'horticulture. Pour les tomates, mais aussi pour les autres cultures.
“Les maladies virales continueront à poser problème à l'avenir. Elles semblent également muter de manière plus agressive et parviennent mieux et plus rapidement à briser les résistances.”
L'épidémie a permis d'acquérir une grande quantité de connaissances. « Avec le recul, il est logique que le virus ToBRFV se soit propagé aussi rapidement », explique Jan, en référence au pouvoir infectieux du virus. En étudiant plus intensivement les différentes méthodes de transmission d'un virus, nous pouvons mieux évaluer si de futurs virus pourraient devenir dangereux.
L'apparition du virus a également entraîné une transformation radicale du secteur de la tomate. « C'est le premier cas grave qui montre l'importance des mesures phytosanitaires. Ces mesures ne disparaîtront pas. Pas de visites dans les serres, désinfection des mains, pas de téléphone », énumère-t-il à titre d'exemple. « Surtout au début de la culture. Certaines des mesures les plus strictes peuvent être économiquement difficiles à maintenir, mais les principes de base seront certainement conservés. »
La vision et l'approche des virus déjà connus ont également été adaptées en fonction des connaissances acquises. Jan fait référence au virus TMV, dont le ToBRFV est un mutant. « Le gène résistant au TMV est le Tm2-2. Avec ce gène, le virus ne peut pas se multiplier et les cellules qui le contiennent meurent. Cela fonctionne si bien que ce gène a été croisé dans toutes les tomates du monde. Mais nous voyons maintenant les conséquences du ToBRFV, qui a contourné cette résistance. Tout d'un coup, l'ensemble de la génétique de la tomate est sensible. Rétrospectivement, nous n'aurions peut-être pas dû mettre tous nos œufs dans le même panier, mais plutôt chercher d'autres gènes qui offrent également une résistance, afin d'avoir plus de sécurité. » Bayer se concentre désormais sur ce point.
« La résistance que nous introduisons sur le marché présente désormais une résistance multiple : différents gènes agissent à des moments différents. Par conséquent, la possibilité que le virus surmonte ces gènes simultanément est beaucoup plus faible. Pour l'avenir, nous devons envisager une approche conjointe : une surveillance intensive des nouvelles maladies potentielles et une sensibilisation aux questions phytosanitaires, combinées à une résistance basée de préférence sur des gènes de résistance empilés. »
Pour plus d’informations : Vegetables by Bayer - Centre d’informations ToBRFV
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