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New approach could improve safety assessments of biocontrol pathogens
Mejorando las evaluaciones de seguridad de patógenos como agentes de biocontrol

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Washington, DC
March 19, 2009

Agricultural Research Service, USDA
By Jan Suszkiw

Determining the host range of fungal pathogens that have potential for use as biological controls of weeds should become easier to do, thanks to a new technique developed by Agricultural Research Service (ARS) scientists.

Their approach combines data in unique ways to improve predictions about how certain plants or crops related to a targeted weed might react to the release of a candidate pathogen used in a classical biocontrol program.

Existing methods of determining a pathogen's host range can be labor-intensive, too reliant on narrow data sets, or impractical to use when numerous or hard-to-grow plant species are involved. The new approach also diminishes uncertainty as to whether the reactions of greenhouse-grown plants will reflect the species as a whole under field conditions, according to a paper published in Biological Control and authored by Dana Berner, Bill Bruckart, Craig Cavin and Jami Michael, who work at the ARS Foreign Disease-Weed Science Research Unit in Frederick, Md.

Their approach involves integrating plant-disease reaction scores and other data with a matrix made up of DNA sequence information that shows the genetic relatedness of plant species to each other and to the target weed. Using a statistical approach similar to so-called "animal mixed models," scientists can predict the probable susceptibility of different plants to the weed pathogen. This may also narrow the list of plants necessary for planning quarantine studies.

Berner's team has used the approach to determine the host range and safety of releasing the rust fungus Uromyces salsolae for biological control of Russian thistle, Salsola tragus, more commonly known as tumbleweed. Of 64 species analyzed using the mixed-model equation, only seven--all Salsola--showed susceptibility to the fungus, indicating its high specificity.

Although symbolic of the Wild West, tumbleweed is a noxious pest. It can infest crop fields, harbor pathogens, deplete soil moisture, pose a fire hazard and endanger motorists. Biocontrol offers a sustainable alternative to herbicide spraying and physical controls like mowing, especially across large swaths of infested land.

ARS is the principal intramural scientific research agency of the U.S. Department of Agriculture.


Mejorando las evaluaciones de seguridad de patógenos como agentes de biocontrol

Una nueva técnica desarrollada por científicos del Servicio de Investigación Agrícola (ARS) podría facilitar la determinación de la gama de huéspedes de ciertos patógenos fúngicos que tienen potencial como agentes de control biológico contra malezas.

Este nuevo enfoque combina datos en maneras únicas para mejorar las predicciones sobre cómo plantas o cultivos relacionados con una maleza objetivo podrían reaccionar a la liberación de un patógeno usado en un programa de biocontrol clásico.

Métodos actuales de determinar la gama de huéspedes de un patógeno requieren mucho labor, son demasiado dependientes de datos limitados, o son poco viables cuando el proyecto involucra numerosas especies de planta, o plantas difíciles de cultivar.

El nuevo enfoque también disminuye incertidumbre sobre si las reacciones de las plantas cultivadas en invernaderos reflejarán la reacción de la especie en su totalidad bajo condiciones de campo, según un papel publicado en la revista 'Biological Control' (Control Biológico) y escrito por Dana Berner, Bill Bruckart, Craig Cavin y Jami Michael. Ellos trabajan en la Unidad de Investigación de Enfermedades Extranjeras y la Ciencia de Malezas mantenida por el ARS en Frederick, Maryland.

Su enfoque involucra integrar las puntuaciones de la reacción de la planta a enfermedades y otros datos con un matriz de información sobre secuencias genéticas que muestra las conexiones genéticas entre las especies de plantas y la maleza objetivo. Con el uso de un enfoque estadístico similar a lo que se llama "un modelo mezclado animal", los científicos pueden predecir la probable susceptibilidad de diferentes plantas al patógeno que controla la maleza. Esta capacidad también podría reducir la lista de plantas necesitadas para planear estudios de cuarentena.

El grupo de Berner ha usado este enfoque para determinar la gama de huéspedes y la seguridad de poner en libertad el hongo de roya llamada Uromyces salsolae para el control biológico del cardo ruso, Salsola tragus, más comúnmente conocido como la barrilla. Entre las 64 especies analizadas usando la ecuación del modelo mezclado, solamente siete especies--todas en la familia Salsola---mostraron susceptibilidad al hongo, indicando el nivel alto de especificidad del hongo.

Aunque simbólico del Lejano Oeste americano, la barrilla es una plaga nociva. Puede infestar campos de cultivo, servir como un huésped para patógenos, agotar la humedad del suelo, poseer un riesgo de fuego, y poner en peligro los automovilistas. Métodos de biocontrol ofrecen una alternativa sostenible a la aplicación de herbicidas y la utilización de controles físicos tales como segando, especialmente en grandes áreas de tierra infestada.

ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del Departamento de Agricultura de EE.UU.

 

 


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