ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA
Luis Pons, (301) 504-1628, lpons@ars.usda.gov
October 8, 2004

Detailed genome maps of the cereal crops maize and sorghum are thought to be at least three years away. But Agricultural Research Service computational biologist Doreen Ware believes scientists shouldn't have to wait that long for these maps.

Ware, based at the ARS U.S. Plant, Soil and Nutrition Laboratory in Ithaca, N.Y., and colleagues are trying to give researchers a head start on these studies by supplementing what's currently known about the genetic makeup of sorghum and maize with data from the genome map of rice.

Rice, the first crop to be almost fully genetically sequenced, is a relative of the two cereal crops. However, the genomes of maize and sorghum will take longer to complete because they are large and complex, compared to the rice genome.

Ware is enhancing data already in the public domain to highlight points of similarity between the genomes of each crop. She's working with collaborators at the Cold Spring Harbor Laboratory on New York's Long Island, Texas A&M and Purdue universities, and the University of Missouri.

According to Ware, the study will add to knowledge of genome organization and the evolutionary relationship between three agronomically important crops. Researchers will also develop methods for building and finishing comparative maps that can be applied to future genome-scale projects.

Ultimately, the project may help scientists and growers identify genes responsible for traits that will lead to stronger, more nutritious crops. She has received a $1.3-million "Young Investigators" award from the National Science Foundation for this study. The foundation is an independent federal agency supporting fundamental research and education across all fields of science and engineering.

Ware is working at the Cold Spring Harbor Laboratory, a private, nonprofit institution, because it allows her access to cutting-edge genomics expertise and equipment.

Read more about the research in the October 2004 issue of Agricultural Research magazine, available online at:
http://www.ars.usda.gov/is/AR/archive/oct04/rice1004.htm

ARS is the U.S. Department of Agriculture's chief scientific research agency.
 

Un comienzo ventajoso en mapear los genomas de dos cosechas de cereal

Servicio Noticiero del Servicio de Investigación Agrícola (ARS siglas en inglés)
Departamento de Agricultura (USDA siglas en inglés)
Luis Pons, (301) 504-1628, lpons@ars.usda.gov
8 de octubre 2004

Se piensa que se tardará por lo menos tres años más para completar los mapas genómicos detallados de dos cosechas de cereal, maíz y sorgo. Pero la bióloga computacional Doreen Ware del Servicio de Investigación Agrícola (ARS) cree que científicos no deben esperar tanto por estos mapas.

Ware, en el Laboratorio Estadounidense de Planta, Suelo y Nutrición, mantenido por el ARS en Ithaca, Nueva York, y sus colegas están tratando de proveer una ventaja inicial a los investigadores suplementando lo que actualmente se sabe sobre la composición genética de sorgo y maíz, usando datos del mapa genómico de arroz.

Arroz, la primera cosecha casi completamente secuenciada genéticamente, es pariente de las dos cosechas de cereal. Sin embargo, los genomas del maíz y sorgo tomarán más tiempo para completar porque son grandes y complejos, comparados con el genoma del arroz.

Ware está aumentando datos ya disponibles en el dominio público para realzar puntos semejantes entre los genomas de cada cosecha. Ella está trabajando con colaboradores del Laboratorio de Cold Spring Harbor en Long Island (Nueva York), la Universidad de Texas A&M, la Universidad Purdue y la Universidad de Misurí.

Según Ware, el estudio agregará al conocimiento sobre la organización genómica y la relación evolucionaría entre tres cosechas agronómicamente importantes. Los investigadores también desarrollarán métodos para construir y completar mapas que podrían ser aplicados en el futuro a proyectos de escala genómica.

Finalmente, el proyecto podría ayudar a científicos y cultivadores a identificar los genes que son responsables por rasgos que resultarán en cosechas más fuertes y más nutritivas. Para este estudio, ella recibió el "Premio para Investigadores Jóvenes" ('Young Investigators Award' en inglés) de 1,3 millones de dólares de la Fundación Nacional de Ciencia. La fundación es una agencia federal independiente que soporta investigaciones fundamentales y educación a través de todas esferas de ciencia e ingeniería.

Ware está trabajando en el Laboratorio de Cold Spring Harbor, una institución privada filantrópica, porque allí ella tiene acceso a la pericia y herramientas genómicas de filo cortante.

Más información sobre esta investigación se encuentra en la revista 'Agricultural Research' de octubre del 2004.
http://www.ars.usda.gov/is/AR/archive/oct04/rice1004.htm

ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del Departamento de Agricultura de EE.UU.