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ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA
Jim Core, (301) 504-1619,
jcore@ars.usda.gov
December 13, 2004
Agricultural Research Service scientists recently completed an
agronomic analysis of an important rice genebank, providing
breeders with valuable information that they can use to improve
this vital crop.
The researchers analyzed the U.S. Department of Agriculture Rice
Core Collection, part of the National Small Grains Collection
(NSGC). The rice core collection's 1,801 entries represent about
10 percent of the 17,396 rice accessions in the NSGC.
The ARS analysis shows that the core collection captures more
than 70 percent of the genetic variation in all the NSGC lines,
according to estimates. Reaching this milestone will help
researchers to find genes that have important traits and to
transfer those genes to commercial cultivars.
NSGC is part of the ARS-coordinated National Plant Germplasm
System (NPGS), a cooperative effort by public and private
organizations to preserve the genetic diversity of plants.
Accessions are included in a database so scientists worldwide
can search for specific characteristics that interest them, and
can request the germplasm for research.
Wengui Yan, a geneticist at the ARS Dale Bumpers National Rice
Research Center (DBNRRC) in Stuttgart, Ark., leads efforts to
build the core collection. He completed the agronomic analysis
in collaboration with Tom Tai, a rice geneticist in the ARS
Crops Pathology and Genetics Research Unit at Davis, Calif.;
Harold Bockelman, curator of NSGC in Aberdeen, Idaho; and J.
Neil Rutger, director, DBNRRC.
Last year, Yan froze leaf tissues of the core collection lines
for molecular analyses. Molecular geneticists have developed 183
Simple Sequence Repeat (SSR) markers to locate genes that
determine agronomic traits and quality. The ARS scientists at
Stuttgart have completed the SSR analysis for 300 of 1,801
entries.
ARS scientists at the Rice Research Unit in Beaumont, Texas,
assisted by analyzing molecular markers related to grain
quality. Thanks to joint federal and state efforts, 21 out of 30
descriptors used to describe plant traits, such as aroma and
pest resistance, have been evaluated for this collection.
ARS is the USDA's chief scientific research agency.
Científicos usaron colección de arroz para identificar rasgos
valiosos
Servicio Noticiero del Servicio de Investigación Agrícola (ARS
siglas en inglés)
Departamento de Agricultura (USDA siglas en inglés)
Jim Core, (301) 504-1619,
jcore@ars.usda.gov
13 de diciembre 2004
Científicos del Servicio de Investigación Agrícola (ARS)
recientemente completaron un análisis de un banco importante de
genes de arroz, el cual les provee a los cultivadores
información valiosa que ellos pueden usar para mejorar esta
cosecha esencial.
Los investigadores analizaron la Colección Principal de Arroz
del Departamento de Agricultura de EE.UU. (USDA por sus siglas
en inglés), la cual es parte de la Colección Nacional de Granos
Pequeños (NSGC por sus siglas en inglés). Estas 1.801
selecciones de la colección principal de arroz representan como
10 por ciento de las 17.396 muestras en NSGC.
El análisis por ARS demuestra que la colección principal
representa más de 70 por ciento de la variación genética en
todas las líneas de NSGC, según estimaciones. Alcanzar este hito
importante ayudará a los investigadores a encontrar los genes
que tienen rasgos importantes y transferir estos genes a los
cultivares comerciales.
NSGC es parte del Sistema Nacional de Germen Plasma de Plantas,
el cual es coordinado por ARS. El sistema es una campaña
cooperativa por organizaciones públicas y privadas para
preservar la diversidad genética de plantas. Este sistema
incluye muestras de plantas en una base de datos que científicos
mundialmente pueden usar para buscar características específicas
que les interesan, y pedir el germen plasma para
investigaciones.
Wengui Yan, un genetista en el Centro Nacional Dale Bumpers de
Investigación de Arroz (DBNRRC por sus siglas en inglés)
mantenido por ARS en Stuttgart, Arkansas, dirige actividades de
aumentar la colección principal. Él realizó el análisis
agronómico en colaboración con Tom Tai, un genetista de arroz en
la Unidad de Investigación de la Patología y Genética de
Cosechas mantenida por ARS en Davis, California; Harold
Bockelman, conservador de NSGC en Aberdeen, Idaho; y J. Neil
Rutger, director de DBNRRC.
El año pasado, Yan congeló tejidos de hojas de las líneas de la
colección principal para análisis molecular. Genetistas
moleculares han desarrollado 183 marcadores de secuencias
simples repetitivas (SSR por sus siglas en inglés) para
localizar los genes que determinan rasgos de calidad y
agronómicos. Científicos del ARS en Stuttgart han terminado este
análisis de SSR para 300 de las 1.801 muestras en la colección.
Científicos del ARS en la Unidad de Investigación de Arroz en
Beaumont, Texas, ayudaron con los estudios analizando marcadores
moleculares relacionados a la calidad de grano. Gracias a las
acciones cooperativas federales y estatales, 21 de los 30
descriptores usados para describir los rasgos de plantas, tales
como aroma y resistencia contra plagas, han sido evaluados para
esta colección.
ARS es la agencia principal de investigaciones científicas
del USDA. |
