ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA
Don Comis, (301) 504-1625, comis@ars.usda.gov
April 1, 2004

A "new guard" of geneticists at the Agricultural Research Service is leading a genetic revolution in the sugar beet industry, with funding from the Beet Sugar Development Foundation (BSDF) of Denver, Colo. During the past decade, the ARS scientists have been changing their breeding strategy from trait-based to gene-based selection, and in the past five years have begun a project to map the sugar beet genome.

The ARS group is one of just a few in the world and the only one in the United States working on the sugar beet genome. The group includes J. Mitchell McGrath, who heads a research team at the ARS Sugar Beet and Bean Research Unit at East Lansing, Mich.; plant pathologist John Weiland at ARS' Sugar Beet and Potato Research Unit at Fargo, N.D.; plant geneticist Leonard Panella of ARS' Sugar Beet Research Unit at Fort Collins, Colo.; and Robert Lewellen, plant geneticist at ARS' Crop Improvement and Protection Research Unit at Salinas, Calif.

Already, McGrath's group and two independent groups in Germany have deposited more than 20,000 ESTs (expressed sequence tags) into the National Center for Biotechnology Information's GenBank site (www.ncbi.nlm.nih.gov). These tags identify probably one-third to one-half of the 30,000 genes thought to make up the functional part of the sugar beet genome.

McGrath worked with Weiland and a contract firm to package a BAC (bacterial artificial chromosomes) "library." This type of "library" uses safe strains of bacteria to store sugar beet DNA. These sequences are then either screened with genetic markers, or compared with sequences of known genes, to connect them to possible traits. Each clone in the library of 38,400 cloned bacteria stores a different DNA sequence from the sugar beet's genome. Panella and Lewellen also collaborated on the library.

Under a Memorandum of Understanding between the U.S. Department of Agriculture and the BSDF, ARS is charged with developing basic germplasm lines and releasing them to the foundation, for distribution to BSDF members.

Read more about the research in the April issue of Agricultural Research magazine, available online at:
http://www.ars.usda.gov/is/AR/archive/apr04/beet0404.htm

ARS is USDA's chief scientific research agency.

Un "grupo nuevo" de científicos está descifrando el genoma de la remolacha azucarera

Servicio Noticiero
del Servicio de Investigación Agrícola (ARS siglas en inglés)
Departamento de Agricultura (USDA siglas en inglés)
Don Comis, (301) 504-1625, comis@ars.usda.gov
1 de abril 2004

Un "grupo nuevo" de genetistas en el Servicio de Investigación Agrícola
(ARS) está dirigiendo una revolución genética en la industria de la remolacha azucarera, con apoyo financiero de la Fundación para el Desarrollo de Azúcar de Remolachas (BSDF por sus siglas en inglés) de Denver, Colorado. Durante la última década, los científicos del ARS han estado cambiando su estrategia de cultivación--de una basada en los rasgos a una basada en la selección genética--y en los últimos cinco años han comenzado un proyecto para mapear el genoma de la remolacha azucarera.

El grupo del ARS es uno de pocos grupos en el mundo y el único en los EE.UU. que está trabajando en el genoma de la remolacha azucarera. El grupo del ARS incluye J. Mitchell McGrath, líder de un grupo de investigación en la Unidad de Investigación de la Remolacha Azucarera y las Habichuelas, en East Lansing, Michigan; el patólogo de planta John Weiland en la Unidad de Investigación de la Remolacha Azucarera y la Papa, en Fargo, Dakota del Norte; el genetista de plantas Leonard Panella de la Unidad de Investigación de la Remolacha Azucarera, en Fort Collins, Colorado; y el genetista de planta Robert Lewellen en la Unidad de Investigación Sobre el Mejoramiento y la Protección de Cosechas, en Salinas, California.

El grupo de McGrath y dos grupos independientes en Alemania ya han depositado más de 20.000 etiquetas de secuencia expresada (ESTs por sus siglas en inglés) en la página cibernética GenBank
(www.ncbi.nlm.nih.gov) del Centro Nacional de Información Sobre Biotecnología. Estas etiquetas identifican de un tercio a la mitad de los 30.000 genes que podrían componer la parte funcional del genoma de la remolacha azucarera.

McGrath trabajó con Weiland y una empresa comercial para crear una "biblioteca" de cromosomas artificiales bacterianas (BAC por sus siglas en inglés). Este tipo de "biblioteca" utiliza razas seguras de bacteria para almacenar el ADN de la remolacha azucarera. Luego, estas secuencias se evalúan con marcadores genéticos, o se comparan con secuencias de genes conocidos, para conectarlos a rasgos posibles. Cada clon en la biblioteca de 38.400 bacterias clonadas almacena una secuencia diferente del ADN del genoma de la remolacha azucarera. Panella y Lewellen también colaboraron en la creación de la biblioteca.

Según un memorándum de entendimiento entre el Departamento de Agricultura de EE.UU. (USDA por sus siglas en inglés) y la BSDF, ARS tiene la responsabilidad de desarrollar líneas básicas de germen plasma de la remolacha azucarera, y lanzarlas a la fundación para distribución a los miembros de la BSDF.

Se puede leer más sobre esta investigación en la revista 'Agricultural Research' de abril, disponible en Internet en: http://www.ars.usda.gov/is/AR/archive/apr04/beet0404.htm

ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del USDA.