ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA
Luis Pons, (301) 504-1628, lpons@ars.usda.gov
August 18, 2003

The Agricultural Research Service was among several institutions taking part in a recent project that sequenced the genome of a microbe that infects tomato plants and whose close relatives infect many other crops.

The sequencing of the strain of Pseudomonas syringae that causes bacterial speck disease in tomato plants was led by scientists at Cornell University in Ithaca, N.Y., and The Institute for Genomic
Research in Rockville, Md. Funded by the National Science Foundation in Arlington, Va., the project is featured online today in the journal Proceedings of the National Academy of Sciences.

Molecular biologist Samuel W. Cartinhour and computational biologist David J. Schneider, both with ARS' U.S. Plant, Soil and Nutrition Research Laboratory in Ithaca, contributed to the joint effort. Their
computational analyses of sequence data helped the research team make preliminary findings about the roles of the more than 5,500 genes in P. syringae, including clues as to how it infects plants.

The ARS scientists scanned the sequence to identify a set of short DNA motifs, known as "hrp boxes," that have an important role in activating genes involved in plant disease. They also identified a group of proteins, known as "effectors," that are transported from P. syringae into plant cells during infection.

While the sequenced strain of P. syringae primarily affects tomatoes, it also infects Arabidopsis thaliana. That small, flowering member of the mustard (Brassicaceae) family is widely used as a model organism in plant biology. The strain thus creates a model pair for plant pathogen studies.

In addition, P. syringae is closely related to P. aeruginosa, which can infect humans and animals, and to P. putida, a bacterium with uses in environmental cleanup. It also shares a key infection mechanism with other plant-infecting bacteria.

The Boyce Thompson Institute for Plant Research in Ithaca, the University of Nebraska, the University of Missouri and Kansas State University also took part in the project.

ARS is the U.S. Department of Agriculture's principal scientific research agency.

ARS tuvo un papel clave en el proyecto de secuenciar DNA de un microbio dañoso

Servicio Noticiero del Servicio de Investigación Agrícola (ARS siglas en inglés)
Departamento de Agricultura (USDA siglas en inglés)
Luis Pons, (301) 504-1628, lpons@ars.usda.gov
18 de agosto 2003

El Servicio de Investigación Agrícola (ARS) fue uno de varias instituciones que participaron en un proyecto reciente de secuenciar el genoma de un microbio que infecta plantas de tomate y que sus parientes cercanos afectan muchas otras cosechas.

El secuenciar de la raza de Pseudomonas syringae que causa la enfermedad del moteado bacteriano en plantas de tomate, fue dirigido por científicos en la Universidad Cornell en Ithaca, Nueva York, y el
Instituto para Investigaciones Genómicas en Rockville, Maryland. Financiado por la Fundación Nacional de la Ciencia en Arlington, Virginia, el proyecto está siendo demostrado en Internet hoy en la
revista 'Proceedings of the National Academy of Sciences' (Procedimientos de la Academia Nacional de Ciencias).

El biólogo molecular Samuel W. Cartinhour y el biólogo computacional David J. Schneider del ARS contribuyeron al esfuerzo colectivo. Cartinhour y Schneider trabajan en el Laboratorio de EE.UU. para
Investigaciones Sobre las Plantas, el Suelo y la Nutrición, mantenido por ARS en Ithaca. Su análisis computacional de los datos acerca de la secuencia genómica ayudó al grupo de investigación a desarrollar hallazgos preliminares acerca de las funciones de los más de 5.500 genes en P. syringae, incluyendo indicios de como el microbio infecta las plantas.

Los científicos del ARS examinaron la secuencia para identificar una colección de "temas" del DNA, conocidos como "cajas hrp", que tienen un papel importante en la activación de los genes implicados en enfermedades de plantas. También han identificado un grupo de proteínas, conocidas como "efectores", que se transportan de P. syringae hacia el interior de las células de plantas durante infección de la planta.

Mientras que la raza secuenciada de P. syringae primariamente afecta los tomates, también infecta Arabidopsis thaliana. Ese miembro pequeño y floreciente de la familia de la mostaza (Brassicaceae) es usado comúnmente como un organismo modelo en la biología de plantas. En consecuencia, la raza secuenciada crea un par modelo para los estudios de patógenos de plantas.

Adicionalmente, el microbio P. syringae es estrechamente relacionado con P. aeruginosa, que puede infectar humanos y animales, y con P. putida, una bacteria que se puede usar en la limpieza ambiental. P. syringae también tiene un mecanismo clave de infección en común con otras bacterias que infectan plantas.

El Instituto Boyce Thompson para Investigación en Plantas, ubicado en Ithaca, y la Universidad de Nebraska, la Universidad de Misurí, y la Universidad Estatal de Kansas también participaron en el proyecto.

ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del Departamento de Agricultura de EE.UU.