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Genomic "jigsaw puzzle" for wheat scab fungus is put together
"Rompecabezas" de genoma del hongo de la fusariosis de la espiga de trigo se ha resuelto

ARS News Service
Agricultural Research Service, USDA
Don Comis, (301) 504-1625, comis@ars.usda.gov
February 2, 2005

The Agricultural Research Service has played a pioneering role in completing the mapping of the genome of the fungus that causes wheat scab.

The worst ever wheat and barley disease first struck worldwide in the 1990s. Farmers and scientists quickly realized that the usual methods of fighting crop disease--planting resistant crops and applying fungicides--wouldn't be enough. They needed ways to control the fungus genetically.

In 1999, geneticist Corby Kistler arrived at the ARS Cereal Disease Laboratory in St. Paul, Minn., to unravel the genome of the fungus known as Fusarium graminearum. He and University of Minnesota geneticist Liane Gale mapped its DNA, linking about 99 percent of its genome into a genetic map.

The project attracted a $1.9 million grant from the Microbial Genome Sequencing Program administered jointly by the U.S. Department of Agriculture and the National Science Foundation. Kistler shared the award with colleagues at Purdue University in West Lafayette, Ind.; Michigan State University in East Lansing; and the Broad Institute, a major genomics research center, in Cambridge, Mass.

The Broad Institute used sophisticated computer techniques to assemble a physical map from the hundreds of thousands of little bits of DNA sequences that make up all of F. graminearum's genes. Kistler and Gale linked together the last odd pieces. Last year, the institute integrated the Kistler/Gale genetic map into its physical map. The combined map is on the Broad Institute's website at: www.broad.mit.edu/annotation/fungi/fusarium

The genetic map gives an overview of the order of the fungal chromosomes, while the physical map is more detailed. Information gained from the combined map has already accelerated the search for new ways to control wheat scab genetically. For example, the map is helping scientists find the genes that produce toxins that can render surviving wheat and barley unfit for consumption.

Read more about the research in the February 2005 issue of Agricultural Research magazine, available online at:
http://www.ars.usda.gov/is/AR/archive/feb05/fusarium0205.htm

ARS is the U.S. Department of Agriculture's principal scientific research agency.


"Rompecabezas" de genoma del hongo de la fusariosis de la espiga de trigo se ha resuelto

Servicio Noticiero del Servicio de Investigación Agrícola (ARS siglas en inglés)
Departamento de Agricultura (USDA siglas en inglés)
Don Comis, (301) 504-1625, comis@ars.usda.gov
2 de febrero 2005

El Servicio de Investigación Agrícola (ARS) ha jugado un papel pionero en completar el mapa de genoma del hongo que causa la fusariosis de la espiga de trigo.

Esta enfermedad--la cual es la peor del trigo y la cebada--inicialmente infectó cosechas mundialmente en los años noventa. Granjeros y científicos rápidamente se dieron cuenta de que los métodos usuales de combatir enfermedades de cosecha -- sembrar cosechas resistentes y aplicar fungicidas -- no serían suficientes. Ellos necesitaban métodos para controlar el hongo genéticamente.

En 1999, el genetista Corby Kistler del ARS llegó al Laboratorio de Enfermedades de Cereal, mantenido por ARS en St. Paul, Minnesota, para desenmarañar el genoma del hongo conocido como Fusarium graminearum. Él y la genetista Liane Gale de la Universidad de Minnesota mapearon su ADN, enlazando como 99 por ciento de su genoma a un mapa genético.

El proyecto atrajo una subvención de 1,9 millones de dólares del Programa de Secuenciar el Genoma Micróbico, administrado conjuntamente por el Departamento de Agricultura de EE.UU. (USDA por sus siglas en inglés) y la Fundación Nacional de Ciencia. Kistler compartió la subvención con colegas de la Universidad Purdue en West Lafayette, Indiana; la Universidad Estatal de Michigan en East Lansing; y el Instituto Broad, un centro principal de investigación de la genómica, en Cambridge, Massachussetts.

El Instituto Broad usó técnicas sofisticadas de computadora para montar un mapa físico de los cientos de miles de pedazos pequeños de secuencias de ADN que componen los genes de F. graminearum. Kistler y Gale enlazaron los pedazos sobrantes. El año pasado, el instituto integró el mapa genético producido por Kistler y Gale en el mapa físico. El mapa combinado se encuentra en la página cibernética del Instituto Broad en: www.broad.mit.edu/annotation/fungi/fusarium

El mapa genético provee una descripción del orden de los cromosomas del hongo mientras el mapa físico es más detallado. La información obtenida del mapa combinado ya ha acelerado la búsqueda para modos nuevos para controlar genéticamente la fusariosis de la espiga de trigo. Por ejemplo, el mapa está ayudando a los científicos a encontrar genes que producen toxinas que pueden dañar el trigo haciendolo no apto para el consumo humano.

Lea más sobre está investigación en la revista 'Agricultural Research' de febrero 2005. http://www.ars.usda.gov/is/AR/archive/feb05/fusarium0205.htm 

ARS es la agencia principal de investigaciones científicas del USDA.

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